يحرص المركز الوطني لتنمية القطاع الغير ربحي على حماية خصوصية وسرية المعلومات الشخصية لمستخدمي مواقع المركز ويضعها على رأس قائمة الأولويات، يهدف إشعار الخصوصية إلى مساعدة صاحب البيانات الشخصية على فهم نوع المعلومات التي يتم جمعها وتوضيح كيفية معالجة وحماية البيانات الشخصية، ويعتبر إشعار الخصوصية جزء لا يتجزأ من شروط وأحكام استخدام الموقع الالكتروني للمركز الوطني لتنمية القطاع الغير ربحي والتي تمت الإشارة لها في اشعار سياسة خصوصية البيانات و سياسة حماية البيانات الشخصية.

يتم تسجيل التواصل الوارد عبر قنوات استقبال الشكاوى في المركز الوطني لتنمية القطاع غير الربحي بهدف توثيق الشكاوى والملاحظات بدقة، وضمان متابعتها ومعالجتها وفق الإجراءات المعتمدة، وتحسين جودة الخدمات المقدمة للمتعاملين. كما يُستخدم التسجيل لأغراض تحليل البيانات وقياس الأداء، ورفع كفاءة العمليات التشغيلية، وأغراض التدريب وضمان الجودة، مع الالتزام التام بسياسات خصوصية البيانات وحماية البيانات الشخصية والأنظمة ذات العلاقة.